Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SURF1Q15526 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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