Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RAB39AQ14964 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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RAB39AQ14964 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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RAB39AQ14964 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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RAB39AQ14964 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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RAB39AQ14964 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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