Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.4 ms