Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
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GRIK3Q13003 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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GRIK3Q13003 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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GRIK3Q13003 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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GRIK3Q13003 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK3Q13003 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
GRIK3Q13003 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK3Q13003 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK3Q13003 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK3Q13003 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK3Q13003 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK3Q13003 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK3Q13003 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK3Q13003 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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