Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXC1Q12948 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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FOXC1Q12948 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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FOXC1Q12948 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXC1Q12948 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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