Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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SNX13Q9Y5W8 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
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SNX13Q9Y5W8 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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