Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHOC2Q9UQ13 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHOC2Q9UQ13 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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