Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GGA3Q9NZ52 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.4 ms