Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMARCE1Q969G3 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMARCE1Q969G3 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMARCE1Q969G3 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMARCE1Q969G3 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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