Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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DDB1Q16531 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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DDB1Q16531 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDB1Q16531 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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DDB1Q16531 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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