Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF3Q13114 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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