Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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RABGEF1Q9UJ41 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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RABGEF1Q9UJ41 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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RABGEF1Q9UJ41 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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RABGEF1Q9UJ41 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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RABGEF1Q9UJ41 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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RABGEF1Q9UJ41 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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RABGEF1Q9UJ41 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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RABGEF1Q9UJ41 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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