Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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