Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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