Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDB1Q16531 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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