Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ITSN1Q15811 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ITSN1Q15811 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.48□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
ITSN1Q15811 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
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