Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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