Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SQSTM1Q13501 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.9 ms