Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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