Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRCP08575 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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