Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNN3Q15417 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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