Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
IRF5Q13568 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
IRF5Q13568 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IRF5Q13568 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IRF5Q13568 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IRF5Q13568 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IRF5Q13568 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IRF5Q13568 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IRF5Q13568 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IRF5Q13568 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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