Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPREP23469 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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PTPREP23469 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPREP23469 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPREP23469 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPREP23469 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPREP23469 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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PTPREP23469 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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PTPREP23469 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPREP23469 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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PTPREP23469 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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PTPREP23469 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPREP23469 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPREP23469 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPREP23469 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPREP23469 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPREP23469 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPREP23469 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPREP23469 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPREP23469 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPREP23469 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPREP23469 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPREP23469 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPREP23469 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPREP23469 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPREP23469 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPREP23469 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPREP23469 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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