Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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HOXD1Q9GZZ0 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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HOXD1Q9GZZ0 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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HOXD1Q9GZZ0 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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HOXD1Q9GZZ0 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD1Q9GZZ0 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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