Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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