Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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