Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP35Q9P2H5 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP35Q9P2H5 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USP35Q9P2H5 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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USP35Q9P2H5 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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USP35Q9P2H5 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP35Q9P2H5 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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USP35Q9P2H5 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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USP35Q9P2H5 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP35Q9P2H5 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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