Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTF1Q15361 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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