Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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