Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTF1Q15361 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTF1Q15361 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.1 ms