Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.9 ms