Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.4 ms