Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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USP53Q70EK8 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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USP53Q70EK8 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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USP53Q70EK8 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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USP53Q70EK8 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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USP53Q70EK8 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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USP53Q70EK8 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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USP53Q70EK8 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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USP53Q70EK8 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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USP53Q70EK8 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
USP53Q70EK8 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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