Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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DDB1Q16531 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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DDB1Q16531 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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DDB1Q16531 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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DDB1Q16531 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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DDB1Q16531 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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DDB1Q16531 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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DDB1Q16531 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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