Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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SCN9AQ15858 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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SCN9AQ15858 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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SCN9AQ15858 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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SCN9AQ15858 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SCN9AQ15858 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SCN9AQ15858 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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SCN9AQ15858 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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