Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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SNX17Q15036 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SNX17Q15036 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SNX17Q15036 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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SNX17Q15036 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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SNX17Q15036 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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SNX17Q15036 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SNX17Q15036 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SNX17Q15036 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SNX17Q15036 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SNX17Q15036 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SNX17Q15036 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SNX17Q15036 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SNX17Q15036 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SNX17Q15036 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX17Q15036 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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