Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
SQSTM1Q13501 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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