Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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RABGEF1Q9UJ41 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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RABGEF1Q9UJ41 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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RABGEF1Q9UJ41 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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RABGEF1Q9UJ41 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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RABGEF1Q9UJ41 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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RABGEF1Q9UJ41 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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RABGEF1Q9UJ41 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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RABGEF1Q9UJ41 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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RABGEF1Q9UJ41 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1Q9UJ41 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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