Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
BBS9Q3SYG4 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BBS9Q3SYG4 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 298.3 ms