Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.2 ms