Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM63Q969Q1 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM63Q969Q1 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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