Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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