Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXD4Q12950 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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