Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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