Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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