Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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