Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER2Q9H7U1 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER2Q9H7U1 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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