Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LINC00336Q6ZUF6 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.6 ms