Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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