Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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